警视厅搜查一课继续搜查班所属的田川信一，对至今尚未解决的“中野站前居酒屋强盗杀人事件”抱有疑问。在调查过去资料的过程中，田川认为当时的调查不够充分，于是开始了重新调查。在第一次搜查中，从那个手法中把犯人缩小为“值钱的不良外国人”。在踏踏实实地进行询问的过程中，那个事件的初动搜查有问题的事变得清楚了。 被杀害的受害者是互相不认识的兽医和产废业者。如果是以杀死这两个人为目的的计划杀人的话？田川在探索两人的联系中，查明了大型超市和食肉加工业者的关系。就在这时，他与正在追查食品业界问题的记者鹤田真纯再次相见。以前，田川围绕着自己的亲人被鹤田逼着进行采访。虽然空气中弥漫着不稳定的气氛，但此时两人并没有预想到会追踪同样的事件。

被称为“神之手”的考古学家神村贤作（大泉洋 饰）和同伴们经过数年的努力，终于在名不见经传的盐名镇挖出了石器前时代人类活动的证明，由此缔造了足以改写人类历史的爆炸性新闻。专门编撰教科书的亚妻书院派出编辑佐久间里奈（松雪泰子 饰）对神村教授的工作进行跟踪采访，并拟将盐名遗址写入新版教科书中，谁知却又考古界人士透露神村的发现根本就是一起学术造假。另一方面，遗址发掘现场发现一具现代人的女性骨骸，刑警行永太一（田边诚一 饰）深入调查后获悉，死者竟与13年前他所负责的未解悬案有关。 　　盐名和神村教授一时间被推上风口浪尖，而当年杀人案的真正凶手也悄悄返回现场，寻找那晚不慎遗落的重要物件……