电影讲述了武周年间，帝京长安接连发生了几起离奇死亡案件。因为死因不明，忠烈祠飞天壁画杀人的谣言愈演愈烈。百姓纷纷认为是天降不祥，人心惶惶。在地方屡破奇案的狄仁杰和神武军都尉谢瑶环奉命一起调查此案，最终不仅破除了谣言，抓住了真凶，还化解了一段二十余年的恩怨。

大唐年间，金华县有狐妖作祟，中秋前接连有人被咬噬致死。大理寺丞狄仁杰途经金华，阴差阳错地卷入案子，他强行克制自己的心理阴影，抽丝剥茧，最终靠悲悯心揭开了流传了十五年的“狐妖迷案”……

狄仁杰在前往大理寺报道任职之际，浦江境内发生杀人夺金案，现场疑点重重，不仅发现 血藤、秦川粉蝶、树妖的痕迹，还有不止一股势力出现的迹象。到现场勘查的狄仁杰遭到 护花女沈珺瑶的纠缠，与正在调查树妖杀人和黄金失窃案的女官江寒霜撞上，三人结伴调 查真相，隐藏在其中的惊天阴谋逐 渐浮出水面……

酒店开发商奠基当天误挖蛇窝，并惨遭蛇王攻击，事后李老板捐酒店资产做慈善令其子李宗耀不满，欲霸占酒店对父亲下手时得知群蛇攻击酒店，命手下活捉蛇王，目的是利用蛇王的血清做实验研大发横财。万恶终有果，李宗耀等最终未能逃脱蛇王的报复。

法医宋慈上任通古县县令，然上任当天便遇到前来盗取绝命诗案卷宗之人，三年前的一场冤案就此浮出水面，召文阁内数名书生又因绝命诗接连惨死，一时间“绝命诗索命”谣言四起，这一切到底隐藏着何种阴谋，真相终将浮出水面，只是隐藏在真相背后的冤屈，妻离子散的家庭，又该如何重聚……

小小高涯县内暗藏危机；过往杨家灭门惨案究竟是何人所为？真假县令？真假夫君？“是否会真的隐去，假的存了？”且看俊俏马匪刘贝贝如何智斗恶霸，化解危机，伸张正义；千金小姐又如何火眼金睛找出如意郎君？