科学家韦恩·斯萨林斯基发明了能将物体放大缩小的机器，光顾着高兴的他却忘记了告诉他的两个孩子。于是这个神奇的仪器把他的孩子们跟邻居家的两个孩子都给缩小了。四个孩子开始了一次刺激的神奇之旅。院子里的矮小平坦的草坪变成了高耸茂密的 热带雨林，微不足道的昆虫变成了凶猛硕大的野兽，原先稀松平常的东西都瞬间变成了巨型障碍。然而粗心的夫妇发现孩子们失踪后，才意识到大事不妙。怎样才能把孩子们都变回原来的模样呢？而此时最重要的问题是，他们到底在身边的哪个角落……

艾利克斯（哈契·达诺 Hutch Dano 饰）是一名英俊帅气的高中生，在学校里，他参加了曲棍球队，并且很快凭借着出色的表现成为了球队里的明星。一场意外中，艾利克斯闯了个大祸，导致他遭到了球队的冷藏，不仅如此，照顾妹妹艾米丽（G. Hannelius 饰）的责任也落到了他的肩上。 艾利克斯和艾米丽母亲在他们很小的时候就不幸去世了，父亲为了撑起整个家，只能早出晚归的一心扑在工作上。艾米丽请求艾利克斯成为大黄蜂女童子军的指导员，虽然这份工作会给艾利克斯带来很多的麻烦，但也让他飞速的成长起来。不仅如此，艾利克斯和他一直暗恋的女神也因此关系开始亲密起来。

塔克中尉（丹尼斯·奎德 Dennis Quaid 饰）性格冲动，蔑视威权，但他同时是开发缩微飞行器技术的“阿尔法计划”的主驾驶员。塔克酒后胡作非为导致记者女友莉迪亚（梅格·瑞恩 Meg Ryan 饰）愤怒离去，当日的工作则同样遭遇了挫折——一群匪徒闯入研究中心，试图将研制中的缩微飞行器芯片夺走，研究员为了保住芯片，将已经进入缩微状态的塔克和飞行器注入了一名路人杰克（马丁·肖特 Martin Short 饰）的屁股，杰克是一名神经过敏的超市收银员，塔克在杰克的身体内部游走，帮助其躲过匪徒的追踪后返回研究中心求助，然而中心为利益决定放弃杰克体内的塔克，二人无奈只得自救，他们向莉迪亚求助，想要在塔克的氧气耗尽前夺回被抢走的芯片，令塔克恢复原来的大小……