2012年日蚀的一天进行名为“魔宴（Shabbat）”仪式，从而诞生出魔物“魅影（Phantom）”肆虐。 　　本作主角操真晴人在此仪式中生还，如谜一般的白色魔法使把变身系统Wizard Driver交付给他并变身成为假面骑士Wizard。 　　从此踏入守护人类及与魔物战斗的命运。

三年级的弓道部部长岸本杏（池田依来沙饰）决心引退，由二年级的天才学弟三神曜太（中尾畅树饰）继任部长，然而事情却朝着出人意料的方向发展....