在伊豆海岸的一艘赌船上，铁龙会的首领被年轻的保镖石川五右卫门所救。 然而，紧接着，发生了巨大的爆炸，船失事了。 小组的负责人也死了。 爆炸的起因是一个大个子用斧头作为武器。 五右卫门曾经追过那个人，但他逃脱了。 与此同时，成功从赌船上偷钱的鲁邦三世、次元大辅和藤子峰在海上的船上目睹了这一情况。

《鲁邦三世 次元大介的墓碑》是该系列继2012年4月《鲁邦三世～名为峰不二子的女人～》之后推出的又一部外传，主角换成了孤高枪手次元大介，讲述他夺取目标、与强敌对决，以及如何成为鲁邦三世搭档的故事。 鲁邦三世与次元大介为了得到秘宝“小小彗星”潜入东德洛阿。东德洛阿因为本国的著名歌手 玛尔塔在邻国西德洛阿被刺杀而与该国进入一触即发的紧张状态。鲁邦三世与次元大介成功得 到了“小小彗星”，但在逃走时，次元大介被狙击。 是谁狙击了次元大介？为了什么？看到穿过身体的子弹，次元注意到这与在西德洛阿被暗杀的 歌手的子弹是一样的。 次元大介与鲁邦一起来到墓地。两人惊讶地发现那里居然有“次元大介”的坟墓 ！ 从这个信息次元大介推测出犯人，那就是在暗杀前会提前为死者准备坟墓的奥崎，没人能从他 的暗杀下逃出。 鲁邦与次元两人潜入奥崎的秘密小屋，从一间房间的屏幕上看到了被囚禁的不二子！这时，奥 崎出现。 对决的时刻来到了。打破静寂的枪声！被打中的是——！ 再见了，次元……！

遥远的未来，飞行交通工具已经取代了汽车，但是赛车这项运动仍然在各个星球广受欢迎。著名的“红线”赛事是赛车界级别最高的比赛，也是众多车手的终极梦想。在竞争红线赛的资格赛——“黄线”比赛中，赛车手JP（木村拓哉 配音）幸运的与“少男猎手”索诺西（苍井优 配音）一同晋级红线。本届红线赛在枪弹横飞的“机器世界”举办，令本就暴虐刺激的赛车更具吸引力。然而主办星球的统治者因担心自己星球的秘密暴露，决定在比赛中全力阻击一众车手；另一方面，JP在幼年时曾与索诺西相识，然而后者似乎忘记了这一切。红线赛如期在枪林弹雨中拉开了帷幕