一部从不失手的熟练狙击手戈尔戈13的暗杀工作，描绘了危险的世界局势和国际阴谋的硬汉电影。本作以原作《皇帝的陷阱》为蓝本，采用当时最新的CG技术创作。导演是出崎修。石油大亨伦纳德·道森唯一的儿子被暗杀。这名狙击手是杀手戈尔戈13，其真实姓名和国籍均未知。一段时间后，莫雷蒂主教要求戈尔戈刺杀一个名叫“Z 博士”的人。 Z博士是一位从不在公共场合露面的神秘大人物，他的所有工作都有一个名叫辛迪的女儿做。为了接近Z博士，高尔戈试图联系辛迪，并意识到辛迪的真实身份。辛迪是 Z 博士。然而，在杀死Z博士后，戈尔戈本人就遭到了某人的袭击……戈尔戈遭到多名刺客的袭击，为了保护自己开始了孤独的战斗！

宇宙世紀(U.C.)0093年，成為新吉恩總帥的夏亚·阿兹纳布尔對於依然被地球重力所束縛的人類靈魂感到絕望，決心以激烈的手段加以肅正。查知此事的地球聯邦軍王牌駕駛阿姆罗·雷與其所屬的朗德·贝尔艦隊一起與夏亚所領導的新吉恩軍展開最後的決戰...