初中第一天，黑井真藤偶遇高梨由美，一个害羞内向的女孩让她立刻产生了兴趣。起初，她被避开了，但当 Yomi 碰巧注意到 Mato 手机上附有一只装饰性的蓝鸟时，僵局打破了，这只鸟出自《Li'l Birds At Play》一书。发现他们有共同的兴趣，两人结下了深厚的友谊。在平行宇宙中，年轻女孩作为平行存在存在，Mato 是 Black Rock Shooter，Yomi 是 Dead Master。不知何故，一个世界发生的事情似乎对另一个世界产生了影响，而没有意识到这一事实的女孩们不知不觉地被命运之线纠缠在一起。

旭日初升，清纯少女黑衣麻陶（花泽香菜 配音）终于迎来了期待已久的初中入学式，水手服标志着青春的开始。在学校门口，她邂逅了乘坐豪华轿车上学的同班同学小鸟游优美（泽城美雪 配音），顿时为对方的成熟知性气息所吸引。她主动上前搭话，两人很快成为开心畅谈的好朋友。家境优渥又怎样？履历平平又如何？这些都没有成为障碍，麻陶和优美的友情不断加深。快乐无忧的第一学年转眼过去，升入二年级后，麻陶和优美分入了不同的班级。开朗外向的麻陶似乎很快适应了新的环境，也结交了新的朋友；而一向内向恬静的优美虽然默不作声，心底却依稀升起几分落寞。

“我对普通的人类没有兴趣。你们之中要是有外星人、未来人、异世界来的人、超能力者，就尽管来找我吧！以上。”这位就是在开学的自我介绍中，发言惊爆的凉宫春日。对于平淡无聊的日常生活无法忍受的她，创立了一个不可思议的社团——让世界变得更热闹的凉宫春日的团，通称SOS团。 虽然同班同学阿虚、寡言读书少女长门有希、萌萌学姐朝比奈实玖瑠、神秘转校生古泉一树等人都被她牵扯进来，但是阿虚以外的三人却有着凉宫春日不知道的大秘密。

天上掉下美少女的故事已经落伍了，今次是美少女破土而出！ 高中生御厨仁用古树的木材雕刻了精灵像木雕，本打算以此参加地区展览会。不想搬运中，木雕掉在地上，竟然突然变出一位蓝发美少女！ 这是怎么回事？漫画中美少女出现，住进主角家的荒唐剧情难道要发生在仁身上了吗？正当仁因这突如其来的变化而不知所措之际，少女开口说道：“吾乃产土神也。” 这位叫做薙的少女自称是神灵显灵，手拿动画片中的魔法棒去消灭“秽”。但是无论怎么看，薙不过是个爱耍大小姐脾气的可爱女孩。 仁，面对这位破土而出的少女，到底该怎么办？

阿尔扎诺帝国帝国魔术学院的兼职讲师格伦·勒达斯是假自习之名行打瞌睡之实的惯犯。就算难得站上了讲台，他也是专搞直接把课本钉在黑板上之类的花招，耍废的程度连学生也不以为然。被这样的格伦惹恼的学生──有着“师见愁”之名的希丝缇娜·菲伊贝鲁向他提出了决斗。结果令人遗憾地，格伦以悬殊的差距吞下了败战……然而学校发生了前所未有的恐怖事件，学生也无一幸免地受到了波及。“不许伤害我的学生！”如此说的格伦于此时发挥了真正的本领！

不断增长的人口和不断恶化的环境让人类不得不开始考虑起了他们的未来，就这样，“火星地球化”的计划被提上了日程，人们通过向火星地表投放藻类和蟑螂使其颜色变深，如此一来便可吸收阳光提高气温。之后，BUGS1号搭载着六名宇航员，踏上了前往火星的旅程，目的在于生物样本的采集和运送。 　　令六人以及全人类没有想到的是，火星上特殊的气候令生活在其中的蟑螂发生了变异，它们不仅异化拥有了人类的体魄，还产生了极强的攻击性和战斗能力，几乎是在瞬间，六人全军覆没。幸运的是，一只蟑螂的头部样本被传送回了地球，科学家们研究后决定称其为“火星异种”。出乎所有人意料的是，这种可怕的生物在未来，竟然成为了拯救人类的唯一希望。