新的学期开始了，外表凶狠但内心纯良的少年高须龙儿（间岛淳司 配音）决心利用重新分班的机会一扫往日同学对他的误解。更让他高兴的是，自己即将和暗恋了一年有余的栉枝实乃梨（堀江由衣 配音）成为同班同学。除此之外，还有多年的死党北村祐作（野岛裕史 配音）陪伴，一段崭新的高中生活展现在了龙儿的眼前。少女逢坂大河（钉宫理惠 配音）的出现吸引了龙儿的目光，并不是因为此人傲娇腹黑的别扭个性，而是因为在偶然中，龙儿发现，大河居然暗恋着自己的好友祐作。 在相互坦白了暗恋对象后，龙儿和大河决定结成统一的恋爱战线，利用相互的帮助来完成各自的恋爱蓝图。但现实并没有想象的那么简单，在重重的误会和波折之中，两人似乎对对方都产生了超越友谊的情感。

穗村玲子（桥本千波 配音）是一名个性稍微有些内向的女高中生，在转学去了新的学校之后，玲子发现自己的性格导致自己久久无法融入班级圈子里，感到稍稍有些孤独。最近班上流行着名为“WIXOSS”的卡牌游戏，玲子希望以此为契机能够拉近自己和同学们之间的距离，于是走进商店买了一组卡牌。 让玲子没有想到的是，在打开卡牌的一瞬间，牌面上的立绘少女莉露（伊藤静 配音）动了起来，原来，玲子被卷入了一个以记忆为赌注的游戏之中。她的全部记忆被浓缩封印到了五枚硬币之中，这就是她手上的全部筹码，玲子要利用这五枚硬币和其他的参与者进行对决，如果失败了，她将会失去所有的记忆。

赤冢正义（Justice）通称正义，他的掌心有一个刺青。那不是普通的刺青，而是能够扭曲时空、创造出“无”、并带给周遭毁灭性伤害的特殊兵器——“咒纹”。正义决定协助特工少女·伊姬完成她的任务——回收咒纹，但是事情会那么顺利吗——！？

自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。

十六年前，日本通过了《公序良俗健全育成法》，从此往后，一切和“性”相关的信息和字眼就此从世界上彻底消失，公民素质因此而大大提高，整个国家变得无比健康清新。时冈学园是以风纪严明闻名全国的名校，而平凡的高中生奥间狸吉（小林裕介 配音）即将在这里展开全新的校园生活。 一场意外 令狸吉被卷入了一个名为“SOX”的邪恶恐怖组织的阴谋之中，组织中为首的华城绫女（石上静香 配音）竟然是时冈学园学生会的副会长！外表稚嫩，内心老成的早乙女乙女（新井里美 配音），有着同可爱外貌极不相称的腹黑本质的鬼头鼓修理（堀江由衣 配音），在这些“恐怖分子”们的围绕之下，狸吉的生活会发生怎样翻天覆地的变化呢？

故事发生在砂刑历93年。一艘名为“泥鲸”的漂泊船上，生活着513名居民。他们分为两个种族——拥有超能力的“印族”，以及没有超能力的“无印族”，相比于印族，无印族拥有更长的寿命。某一日，一个名为莉柯丝（石见舞菜香 配音）的少女被一位名叫查克罗（花江夏树 配音）的少年发现在了废墟之中，当男孩遇见女孩，命运的齿轮开始了转动。 莉柯丝开始了在泥鲸的生活。德高望重即将成为下一任领导人的斯沃（岛崎信长 配音）、对岛屿外的世界充满了好奇的奥尼（梅原裕一郎 配音）、天真可爱不谙世事的萨米（金元寿子 配音），在岛上，每一段相遇都会交织出一段新的乐章。