“你能，和我组一辈子乐队吗？”高一的春末。羽丘女子学园里的学生基本上都组好了乐队，推迟入学的爱音也在为了能尽快融入班级而急忙寻找乐队成员。在这时候，知道「羽丘的小怪人」灯还没组乐队之后，爱音不由自主地向她搭话……

故事发生在二十一世纪初叶，全球气候持续变暖，融化的冰山淹没了大部分陆地，与此同时，名为“雾之舰队”的战舰群从天而降占领了海域，人类的生存空间逐渐遭到蚕食。千早群像（兴津和幸 配音）是一名士官候补生，某日，一艘名为“伊401”的潜水艇出现在了她的面前。就这样，群像成为了潜水艇的驾驶员。 皮肤黝黑大大咧咧的橿原杏平（宫下荣治 配音）、温婉可人足智多谋的八月一日静香（东山奈央 配音）、带着面具十分神秘的织部僧（松本忍 配音），活泼可爱身手敏捷的四月一日伊织（津田美波 配音），一群怀抱着拯救人类之重大理想的战友们聚集到了潜水艇之中，为了夺回本该属于人类的领地和敌人展开了激烈的战斗。

16岁的少女松前绪花（伊藤かな恵 配音）是一个自由生活在东京的普通女高中生。一如这座虽则繁华却死板枯燥的大都市，她的生活平淡无味。正处在幻想的年纪，绪花时刻期盼着“突然的夜奔、突然的爱恋、突然的离别”这类事情的发生。某天，她期盼的已久的时刻终于到来。因偶然的机缘，绪花来到了外婆（久保田民絵 配音）经营的温泉旅馆喜翠庄。在这个位于石川县的偏远所在，时光仿佛凝滞了一般，依然保留着大正时代浓浓的古意。绪花以员工的身份留在喜翠庄，终日努力工作，也结识了和她年龄相仿的女孩子以及形色各异的住客。在这里，她似乎找到了新的生活方向…… 本片为P.A.Works公司成立十周年原创纪念作品。

长久以来，名为“荒魂”的魔物威胁着人类世界的安全，然而一物降一物，对抗荒魂，则要请出随身携带着御刀的巫女们。她们隶属于日本特别祭祀机动队，是一群特殊的存在。平日里，巫女们在学校中过着平凡的校园生活，然而，一旦荒魂开始肆虐，女孩子们就必须拔出御刀，开始充满了危险和死亡的战斗。 个性开朗活泼的卫藤可奈美（本渡枫 配音）、拥有着和年龄不相称的沉稳气质的十条姬和（大西沙织 配音）、温柔高贵的千金大小姐柳濑舞衣（和气杏未 配音）、沉默寡言内向不羁的糸见沙耶香（木野日菜 配音），在和荒魂战斗的同时，这些少女们还在争夺着专门为她们设置的竞技比赛的冠军宝座。