在一次对治某村庄食尸鬼的超自然事件时，平凡女警女警西洛斯·维多利亚遭到袭击，奄奄一息，关键时刻吸血鬼杀手阿尔卡特出现，铲除食尸鬼，并将西洛斯变成了吸血鬼的一员，她顺理成章也接触到了阿尔卡特背后的神秘组织，即为维护英国基督新教、与反基督怪物作战的皇家国教骑士团（Hellsing），在现任当家伊塔古拉·方布鲁克·维英格茨·赫尔辛的率领下，他们接手一桩桩危险且阴谋重重的任务。在这一过程中，与食尸鬼有关的事件层出不穷，死后背后有另一个神秘组织正在策划惊天阴谋。梵蒂冈特务局第十三课Iscariot机关局长安利哥•马克斯威尔、安德鲁森神父等重要人物相继现身，为了保护英国本土和基督新教，第九次十字军成立，而他们的对手则是纳粹余孽少校所率领的1000头食尸鬼组建的千禧年大军。

在那座歌剧院发生了第三起杀人事件！即将被拆迁的歌剧院中，一群有缘人被招待观赏最后的公演，同样被招待的金田一一、七濑美雪、剑持警部三人也再次被卷入其中。『今晚，歌剧院最后之夜，将上演两具尸体所点缀的华丽最终章』，魅影发出了如此危言耸听的预告信…… 　　在去温泉途中迷路的金田一一、七濑美雪、剑持警部三人，来到了废墟之村——舞兰村。这个村庄发生了遗留的吸血鬼传说引起的谜样杀人事件。吸血鬼的魔爪追逐美雪而来，阿一能够解决这起案件吗？

我的名字是乾十三。经过那场大战后，这座城市满是身体机能受过扩张处理，被称为「扩张者」的人们。我在这里以「处理」与扩张者相关问题的工作作为生计—— 　　一名男子造访了十三——头部为枪的扩张者——的事务所。被视为绑架犯而受到警备局追捕的这名男子，委托十三保护他所绑架的一名小孩。十三究竟会决定怎么做？由飘荡硝烟味的枪口所道出的科幻硬汉漫画在此开幕！！

剧情承接上一季，安兹以耶·兰提尔为根据地建立了“安兹·乌尔·恭魔导国”，但却使安兹陷入了烦恼的境地。他作为一个国家的国王，该如何引导这个国家呢？在雅儿贝德、迪米乌哥斯等优秀的NPC们不眠不休地工作下，魔导国现在成了一个安全且没有饥饿的地方。但是，在那里生活的人们至今仍抱有恐惧和不安，街道像火熄灭了一样安静，失去了曾经的活力。在找不到答案的情况下，安兹一个人访问了冒险者工会，并向工会主席艾因扎克提出一个建议…

时间为2138年。曾卷起一大风潮的虚拟现实体感型网络游戏《YGGDRASIL》即将迎来停服。玩家飞鼠在曾经以同伴和荣华自傲的根据地纳萨力克地下大坟墓，独自一人安静等待着那一刻。 但是，不料发生了“过了结束时间却还没有登出”的异常事态。NPC们开始以自己的意志行动，不止如此，纳萨力克之外展开了从未见过的异世界。飞鼠为了寻找过去的同伴，以公会名安兹·乌尔·恭自称，决定在异世界扬名立万。他与宣誓绝对忠诚的部下一同，向新的地域进军。

在旷日持久的世界大战后，城市中遍布着出于不同原因而接受了机械化改造的人类，这些人被称为“扩张者”。与此同时，扩张技术的开发方，科技公司“贝琉连”也因战争对高科技兵器与扩张改造的需求而迅速膨胀，成为了一手遮天的巨型企业，操控着整个城市。随着扩张技术的发展，扩张者与普通人类之间逐渐产生了隔阂，也出现了许许多多的摩擦，由于过度改造而获得强大力量的“过剩扩张者”开始引发一系列社会问题，qiwan.cc成为了威胁社会稳定的重大隐患。因此，政府下辖的复兴厅设立了名为EMS（扩张者对策局）的机构用以管理与扩张者相关的事务，与称霸一方的贝琉连形成了暗中联系又相互牵制的微妙局面。在混乱的社会秩序中，故事的主角，以一把左轮手枪作为头部的过剩扩张者——乾（qián）十三以“处理屋”的身份活跃在城市中，负责接受委托并处理与扩张者相关的各种棘手案件，以此过着行走于刀尖之上的生活。而这样的生活，因为一次别有隐情的“绑架案件”发生了变化……

暑假最后的那天夜晚，悄悄潜入学校泳池的浅羽直之与一位手腕上嵌有银色球体不可思议的少女伊里野加奈相遇。 新学期，伊里野转学来到浅羽的班级。 似乎不擅于与别人打交道的伊里野，只有在浅羽的面前才可以敞开心扉。学校生活中，两人的关系愈发亲密起来。但是由于频繁的在校内广播中被提名，有时候发生了些不可思议的“反应”... 在这个时候总会出现一名身穿黑色衣服的男子??木夏本及时的使伊里野摆脱窘境。难道伊里野背负着什么难以逃脱的宿命和重大的任务吗...！？ 不久，军事基地要塞城市「園原」和新闻部一直想弄清的不明飞行物UFO的骚乱原因，在通过特殊战斗机“黑色防弹盾”和其驾驶员以及护卫部队的存在这些事实，逐渐查明了真相... 伊里野和浅羽苦恼的“UFO的夏天”现在才刚刚开始...

故事舞台发生在架空的城市──日本美空市美空町，除此之外还有魔女世界和魔法堂等，自称为世界上最不幸的美少女的春风DoReMi，一直相信这世界上有魔女，并希望自己成为魔女后可以向喜欢的人表白。有一天放学时，春风DoReMi经过一间名叫新旗山莉卡魔法堂的店铺，进入一探究竟时，碰巧拆穿了当时魔法堂的老板-魔女莉卡具有魔女身份，而导致她变成魔女青蛙。由于只有正式的魔女才可让魔女莉卡恢复原貌，为了帮助魔女莉卡回复原状，DoReMi成为了魔女见习生，并要在见习魔女9个级别(第9级至第1级)的考试中合格，从而取得魔女的象征──自己的水晶球，才能成为正式魔女，期间，初贵，爱子与DoReMi的妹妹泡泡，因为先后知道DoReMi是魔女见习生，为了不让DoReMi也变成魔女青蛙，因此也陆续成为魔女见习生。为了赚取使用魔力所需的魔法珠，所以要时常在魔法堂帮忙，期间也慢慢的参加升级试，在升级试的途中，Doremi等人获得了精灵陪伴。

即将升上四年级的DoReMi、羽月、小爱及音符已经成为好朋友，但同时也失去魔女身份。一天晚上，她们四人回到了魔法堂想见魔女莉卡一面，而在无意间发现魔女莉卡所遗留下来的吹风机(其实是女王变出来，引导DoReMi一行进入魔女界的工具)，因此想借口把吹风机送回给魔女莉卡以重回魔女世界。在女王刻意安排下，她们四人穿过女王的玫瑰花园，并撞见一位魔女婴儿在皇后玫瑰花中诞生（皇后玫瑰花为一百年开一朵的珍贵的玫瑰花，由其中出生魔力特强的魔女将是未来魔女女王的候选人，按规定撞见魔女婴儿诞生者有扶养之义务）。在大部分的魔女持反对意见之下，女王吩咐她们要照顾这魔女婴儿一年，并恢复她们魔女见习生的身份。期间DoReMi等人要接受九次魔女婴儿定期健康检查，若是任一次检查不合格，魔女婴儿就要送回魔女世界。这魔女婴儿后来由DoReMi命名为小花，意思是从花朵诞生的婴儿。在众人的照顾下小花渐渐长大懂事，但其强大的魔力也带给她们不少麻烦。

作品主要讲述了某天，一款掀起大热潮的VRMMORPG「YGGDRASIL」原本会停止一切服务，但即使过了结束时间，玩家也不会退出游戏，NPC也有了各自的思想。现实世界中喜爱电玩的主人公铃木悟（真名）在等待系统强制登出时，与“安兹·乌尔·恭”公会的成员意外穿越到了异世界，并且自己还变成了拥有骷髅外表的最强魔法师——“飞鼠”。就这样，真正的奇幻传说正式拉开帷幕。

时为2138年。曾卷起一大风潮的虚拟现实体感型网络游戏《YGGDRASIL》即将迎来停服。 玩家飞鼠在曾经以同伴和荣华自傲的根据地纳萨力克地下大坟墓，独自一人安静等待着那一刻。 但，发生了结束时间已过却没有登出的异常事态。 NPC们以自己的意志行动，不止如此，纳萨力克之外展开了从未见过的异世界。 飞鼠为了寻找过去的同伴， 以公会名安兹·乌尔·恭自称，决定在异世界扬名立万。 他与宣誓绝对忠诚的部下一同，向新的地域进军。 将世界收于掌中的死之支配者，于此再临！！

这是一个魔女与人类共存的世界，为了保证魔女的身份不被揭穿，被人类发现了真实身份的魔女都会变成魔女青蛙，唯有另一个拥有正式身份的魔女才能够解开魔法。一次偶然中，一直梦想者能够成为魔女的少女春风Doremi（千叶千惠巳 配音）撞破了魔女莉卡的身份，无奈之下，莉卡只得将春风收为见习魔女。春风必须经历漫长而艰苦的修炼，通过魔女的考试才能够正式获得魔女资格。 在此之后，成熟稳重，性格文静的藤原羽月（秋谷智子 配音），精明强干活泼好动的妹尾爱子（松冈由贵 配音），傲娇跋扈但内心善良的濑川音符（宍戸留美 配音）春风的妹妹春风泡泡（大谷育江 配音）等人都因发现了春风的身份而接连成为了见习魔女。随着时间的流逝，对于女孩们来说，通过魔女考试反而成为了次要目的，最重要的是，一定要利用各自的魔法能力让人们获得幸福。