创世晶石危机一触即发，为了阻止地球毁灭，奥特曼选择了看似平凡的小男孩乐乐作为自己的人间体，面对重重挑战，原本调皮捣蛋的小屁孩在奥特曼的引导下，成为拯救地球的关键人物，而奥特曼超能力的秘密也逐渐被揭晓……

故事发生在乡村小镇的水果店，主人翁虽是个身患重症的小男孩，但并没有磨灭他要成为大英雄的志气与理想，对生活仍然是充满活力与热情。果宝特攻的橙留香偶然地闯入小男 孩家里经营的水果超市，誓要带领水果村民逃离老鼠军团的控制，回到故乡天堂果园……

三剑客成功拯救完水果世界后，由于在花果山大合唱庆祝胜利造成第七层的崩塌，直接伤害到七色彩莲。为求保住彩莲，东方求败被外人蛊惑利用，接受了人类世界的忍术和其他技术去抢救彩莲，但同时也成为了拐带水果们的帮凶。方丈与果姥上山探望东方求败，无意间看出当中端倪，东方求败有灭口之意。三剑客赶到之时，方丈与果姥为保存实力，不单一个装疯扮傻，一个诈死，还出狠招将三剑客打落悬崖，并且疯言疯语，让众人误会三剑客，促使三剑客再无立足之地，必须远走他乡，从而避开东方求败的迫害。

超兽战队被冥王打入封印雪皇的元冥黑洞空间，在逆境中大家遇到雪皇，雪皇回忆起了自己的往事，天羽因为她想起自己的意念，所以她才想起超兽战队的伙伴们，所以决定重新回到超兽战队，超兽战队凭借自己的信念加上雪皇的帮助冲出元冥黑洞。